除毛的原理主要是利用黑色素對雷射光的有效吸收(意即使用亞歷山大雷射=紫翠玉雷射來進行除毛)。當雷射光照射治療部位時，毛幹、毛囊的黑色素會吸收雷射光，光能轉變為熱能，在不傷害周圍其他正常組織的情況下，傳導至毛囊根部以熱能使蛋白質結構變性，破壞毛髮的再生能力，如此才可以達到永久除毛的效果。

雷射除毛必需針對黑色毛髮才有效，且需是處於生長期的毛囊，才能有足夠的黑色素以吸收雷射光。這便是為何雷射除毛無法一次根除，而需分階段治療才能完成的原因。

因為毛囊的生長周期分為成長期、過渡期、休止期3期，而雷射除毛主要是針對成長期的毛髮來破壞，所以除毛也是要分階段性的，大概每2-3個月治療一次，要接受4-6次的治療，才能達到最佳的除毛效果。